16 Bioinformatician Jobs

Aufbau, Planung und Programmierung der IT-Infrastruktur für Datenbanken in der gesundheitsbezogenen Forschung, Archivierung und Dokumentation von Forschungsdaten und wissenschaftlichen Publikationen, Koordination und Management von personenbezogenen, biomedizinischen Daten in internationalen Verbundprojekten nach aktuellen Standards der Datensicherheit, des Datenschutzes und der FAIR-Prinzipien, Plausibilitätschecks und Aufbereitung von Datensätzen aus OMICS-Analysen und epidemiologischen Studien zur statistischen Auswertung, Umsetzung von quantitativen Erhebungsinstrumenten auf digitalen Plattformen, Betreuung und Weiterentwicklung sowohl von Serverdiensten als auch der Netzwerkinfrastruktur, Risikomanagement und Qualitätssicherung, Unterstützung des Teams in Vorbereitung der akademischen Lehre

Aufbau, Planung und Programmierung der IT-Infrastruktur für Datenbanken in der gesundheitsbezogenen Forschung, Archivierung und Dokumentation von Forschungsdaten und wissenschaftlichen Publikationen, Koordination und Management von personenbezogenen, biomedizinischen Daten in internationalen Verbundprojekten nach aktuellen Standards der Datensicherheit, des Datenschutzes und der FAIR-Prinzipien, Plausibilitätschecks und Aufbereitung von Datensätzen aus OMICS-Analysen und epidemiologischen Studien zur statistischen Auswertung, Umsetzung von quantitativen Erhebungsinstrumenten auf digitalen Plattformen, Betreuung und Weiterentwicklung sowohl von Serverdiensten als auch der Netzwerkinfrastruktur, Risikomanagement und Qualitätssicherung, Unterstützung des Teams in Vorbereitung der akademischen Lehre

Mitarbeit in Digital Health-Projekten am Institut bzw. Forschungsprojekten des Universitätsklinikums Heidelberg zur Digitalisierung, Konzeption und Implementation von medizinischen Informationssystemen und Datenanalyse-Pipelines, Publikation von Forschungsergebnissen, Mitarbeit in der Lehre für Studierende der Medizin und Medizininformatik

Wissenschaftliche Aufbereitung medizinischer Routinedaten aus der Krankenversorgung für die medizinische Forschung, Unterstützung der Abteilungsleitung beim Management von Projekten im Umfeld des Auf- und Ausbaus der Forschungs-IT am Universitätsklinikum Augsburg, Anforderungsanalyse, Konzeption, Design und Implementierung von Datenbanken und ETL-Prozessen, Datenerschließung von Quellsystemen des Universitätsklinikums Augsburg (u.a. aus dem KIS Dedalus Orbis), Programmierung, Pflege und Betrieb von Software im Bereich der klinischen Forschung, Aufbau und Betrieb von medizinischen Forschungsdatenbanken

Aufbau und Betrieb von Datenbank- und Applikationsservern sowie von Serverinfrastrukturen (lokal und in der Cloud) zur Unterstützung von Forschungsprojekten, Verantwortung für die Netzwerkadministration (Unix, Windows) sowie Hardware-, Netzwerk- und Softwaremanagement/Betrieb, Organisation der Aufstellung und Weiterentwicklung eines IT-Konzepts (Datenschutz und Datensicherheit, Vernetzung, Ausstattung mit Hard- und Software, Beschaffung), Betreuung der Kommunikation mit dem Rechenzentrum der Universität (Vermittlung von RZ-Diensten, Verwaltung, IP-Adressen etc.), Betreuung der Veranstaltungstechnik bei Kongressen, Symposien und Workshops, Beratung und Unterstützung der Beschäftigten des Instituts bei der Einrichtung und Beschaffung wissenschaftlicher Arbeitsplätze

Planung, Design, Datenmanagement und biostatistische Auswertung klinischer Studien, Planung neuer Studien und Projekte einschließlich Mitarbeit an Förderanträgen, Kommunikation von Methoden und Ergebnissen mit klinischen Wissenschaftlern und/oder Ärzten, Mitarbeit an Publikationen und Präsentationen, Data visualization, Entwicklung und Betreuung von Analyse-Pipelines, insbesondere im -omics Bereich, Pflege von Codebasen über ein Versionskontrollsystem (Git), Entwicklung, Implementierung und Pflege von Standard Operation Procedures (SOP)

Molekularbiologie: Klonierung, qPCR, Biochemische Analyse von Proteinen: Aufreinigung, Charakterisierung, Western Blot, CRISPR / Cas9 Genom-Editierung, Zellkultur: Bakterien, Insekten, Säugetiere, Plate-Reader-Assays und Proteinaktivitätstests, Betrieb und Wartung von Laborgeräten und Organisation

Mitarbeit in einem interdisziplinären Projekt zur Weiterentwicklung und Praxiserprobung digitaler Humus- und Nährstoff-Managementsysteme in Zukunftsbetrieben zum Klimaschutz, Integration satellitengestützter Daten in ein webbasiertes Nährstoffmanagementsystem, Spezifikation von Algorithmen in Zusammenarbeit mit den agrarwissenschaftlichen Experten, Implementierung von Algorithmen und Schnittstellen mit moderner IT Technologie, Integration von statistischen und KI-basierten Datenanalyse-Methoden, Realisierung von automatisiertem Zugriff auf im Internet verfügbare Daten via API-Schnittstellen, Programmierung graphischer Oberflächen und der Erzeugung automatisch generierter Karten

Allgemeine Zelllabortätigkeiten (Zellkultur, Kryokonservierung, Autoklavieren/Sterilisation, Medienpräparation, Plasmidpräparation, gentechnische Arbeiten der Sicherheitsstufe 1), Eigenständige Planung, Durchführung, Auswertung und Dokumentation von zellbasierten Experimenten, Experimentelle Unterstützung des wissenschaftlichen Personals, Sicherstellung von Laborarbeitspraktiken und -richtlinien, Koordination der Zellkulturaktivitäten, Beschaffung von Verbrauchsmaterialien, Reagenzien und Kleingeräten, Dokumentation der Zelllinien- und Plasmidbestände, Instandhaltung von Laborgeräten, Einweisung von wissenschaftlichem Personal und Studierenden, Begleitung von wissenschaftlichem Personal und Studierenden bei zellbasierten Experimenten

Anwendung und Verfeinerung molekularer Methoden zur Analyse von Mikrobiomen, Untersuchung der Wechselwirkungen zwischen Tiermikrobiomen und freien mikrobiellen Gemeinschaften, Durchführung von Feldarbeiten in Zusammenarbeit mit Projektpartnern, Analyse von Museumsexemplaren und Umweltmaterialien mittels hochdurchsatz Sequenzierung, Metagenomische Sequenzierung zur Analyse funktioneller Gene der Mikrobiome

Übernimm die wissenschaftliche Verantwortung für spannende Projekte im Qualitätskontrolllabor, speziell für die analytische Prüfung und Freigabe von Wirk- und Arzneistoffen auf Basis von Oligonukleotiden, Gestalte aktiv die Pflege und Weiterentwicklung unseres QM-Systems mit und trage so maßgeblich zur Optimierung bei, Stelle sicher, dass alle Analysen termin- und GMP-gerecht durchgeführt werden, Bewerte Prüfergebnisse einschließlich OOS, Abweichungen und Änderungsprozesse, Erstelle und präsentiere Test- und Studienergebnisse im Rahmen von Inspektionen und Audits, Perspektivisch übernimmst du fachliche und disziplinarische Führungsaufgaben und kannst dich in einer wachsenden Organisation weiterentwickeln

Unterstützung beim Aufbau der betrieblichen Infrastrukturen für das FIS-Natur am IT-DLZ, Sicherstellung des reibungslosen Betriebs der Datenbanken und Anwendungsserver-Infrastruktur, Beteiligung an der erfolgreichen und termingerechten Inbetriebnahme von neuen oder angepassten IT-Systemen, Mitwirkung bei der Fortentwicklung der Betriebskonzepte für FIS-Natur, Entwicklung von Monitoring-Konzepte für die modernisierten Anwendungen des FIS-Natur, Analyse von Betriebsstörungen und Anwendungsfehlern sowie Unterstützung bei deren Beseitigung

Integration von in vivo und in vitro Daten in eine MySQL Datenbank, Analyse der Daten mit Hilfe von R-basierten Anwendungen, Verwendung von Biostatistik, Ableitung von Benchmark Konzentrationen

Unterstützung bei der Weiterentwicklung der Biotechnologie-Akademie RLP, Selbstständige Verwaltung der Website der Biotechnologie-Akademie RLP, einschließlich der Identifizierung geeigneter Angebote und Einpflege von Inhalten in geeigneter Form, Durchführung administrativer und kommunikativer Aufgaben, Unterstützung bei der Koordination der Öffentlichkeitsarbeit einschließlich der Organisation und Durchführung von Veranstaltungen der Biotechnologie-Akademie RLP, Unterstützung bei der Umsetzung der Social Media-Strategie sowie Pflege von Social Media-Kanälen

Koordination der Zusammenarbeit der informationstechnischen und epidemiologischen Fachgebiete für die Umsetzung von Interoperabilitätsanforderungen, Identifikation fachlicher und prozessualer Hürden bei der Harmonisierung institutseigener Informationsmodelle sowie die Entwicklung und Umsetzung von Lösungsstrategien, Betreuung und Weiterentwicklung der institutseigenen Informationsangebote über Interoperabilität zur Schulung der Mitarbeitenden, Entwicklung von Materialien und Services zur Unterstützung von Teams bei der Integration von Interoperabilitätsstandards in ihren Projekten

Entwurf, Entwicklung und Anpassung von digitalen Forschungswerkzeugen und -umgebungen, Modellierung, Analyse und Visualisierung von Forschungsdaten, Weiterentwicklung digitaler Methoden unter Einsatz aktueller Technologien, Dokumentation der Entwicklungsarbeiten, Mitarbeit bei der Antragstellung und Berichterstattung von Projektanträgen, Präsentation der Arbeits- und Forschungsergebnisse auf Konferenzen und Workshops