PostDoc - Entwicklung, Anwendung und Evaluierung von Methoden der Hochdurchsatz-Metagenomik in Cloud-basierten Ausführungsumgebungen (w/m/d)
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Intro
Als PostDoc im Bereich Entwicklung, Anwendung und Evaluierung von Methoden der Hochdurchsatz-Metagenomik in Cloud-basierten Ausführungsumgebungen am Institut für Bio- und Geowissenschaften (IBG-5) arbeiten Sie an bioinformatischen Forschungsaktivitäten mit Fokus auf die interdisziplinäre Entschlüsselung und Analyse von Meta-Genomen. Ihre Aufgaben umfassen die Verarbeitung und Analyse von Metagenomdaten, die Entwicklung von Analyse-Workflows mit Cloud-Technologien, administrative Projektarbeit, Trainingskurse für Wissenschaftler:innen, Veröffentlichungen in Fachzeitschriften und die Betreuung von Doktoranden. Sie benötigen ein abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium, Erfahrung in Big-Data-Analysen mit Cloud-Technologien, Programmierkenntnisse, Sicherheit in Linux/Unix, fließende Englischkenntnisse und Bereitschaft zu Reisen und Konferenzen.
Tasks
- Arbeit an einem breiten Spektrum von Methoden und Anwendungen der Metagenomik und des Cloud-Computing
- Verarbeitung, Analyse und Interpretation von Metagenomdaten verschiedener NGS-Plattformen
- Entwicklung von Analyse-Workflows unter Einbindung von Container- und Cloud-Technologien
- Unterstützung der Arbeitsgruppe im Bereich administrativer Projektarbeit
- Unterstützung der Arbeitsgruppe bei der Planung und Durchführung von Trainingskursen
- Veröffentlichung der wissenschaftlichen Ergebnisse in internationalen Fachzeitschriften
- Austausch mit internen und externen Projektpartnern
- (Co)-Betreuung von Doktoranden und Doktorandinnen
Requirements
- Ein abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master) im Bereich der Bioinformatik, Informatik, Mathematik, Ingenieur-, Natur- oder Wirtschaftswissenschaften, oder eines verwandten Studiengangs mit anschließender abgeschlossener Promotion
- Erfahrungen an Big-Data-Analysen in Verbindung mit Cloud-Technologien und Workflows
- Gute Kenntnisse in der Sequenzanalyse und Metagenomik
- Sehr gute Programmierkenntnisse (z.B. in Python oder vergleichbar)
- Kenntnisse relevanter Technologien (z.B. Git, Docker, Nextflow)
- Sicherer Umgang mit Linux/Unix
- Fließende Englischkenntnisse in Wort und Schrift
- Hohes Maß an Selbstständigkeit und Bereitschaft sich in komplexe Themen einzuarbeiten
- Zuverlässiger und gewissenhafter Arbeitsstil
- Gute Publikationsleistung
- Bereitschaft zur aktiven Wissensvermittlung
- Bereitschaft zu Reisen und der Teilnahme an Konferenzen
Benefits
- Teilnahme an Projekttreffen und Konferenzen
- Starke Unterstützung und Mentoring für den Aufbau einer zukünftigen Karriere
- Weiterentwicklung persönlicher Stärken durch umfangreiches Trainingsangebot
- Optimale Voraussetzungen zur Vereinbarkeit von Beruf und Privatleben
- Möglichkeit zum (orts-)flexiblen Arbeiten
- Vermögenswirksame Leistungen und betriebliche Altersvorsorge
- 30 Tage Urlaub sowie alle Brückentage und zwischen Weihnachten und Neujahr dienstfrei
- Vielfältiges und inklusives Arbeitsumfeld
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